Τα πεπτίδια είναι ενώσεις που σχηματίζονται με σύνδεση αμινοξέων μέσω πεπτιδικών δεσμών. Είναι ενδιάμεσα προϊόντα υδρόλυσης πρωτεϊνών, με μοριακές δομές ενδιάμεσες μεταξύ αυτών των πρωτεϊνών και των αμινοξέων. Μια ένωση που σχηματίζεται από τη συμπύκνωση αφυδάτωσης δύο μορίων αμινοξέων ονομάζεται διπεπτίδιο. Ομοίως, υπάρχουν τριπεπτίδια, τετραπεπτίδια, πενταπεπτίδια, και ούτω καθεξής. Τα πεπτίδια που σχηματίζονται από πολλαπλά μόρια αμινοξέων είναι γνωστά ως πολυπεπτίδια, ενώ οι αλυσίδες που υπερβαίνουν γενικά τα 50 αμινοξέα ταξινομούνται ως πρωτεΐνες.
Για παράδειγμα, ο αντι{0}}παράγοντας γλυκοζυλίωσης καρνοσίνη είναι ένα διπεπτίδιο που σχηματίζεται από τη συμπύκνωση αλανίνης και L-ιστιδίνης. Το αντιοξειδωτικό γλουταθειόνη σχηματίζεται από τη διαδοχική συμπύκνωση γλουταμικού οξέος, κυστεΐνης και γλυκίνης. και το μπλε πεπτίδιο χαλκού GHK-Cu είναι ένα σύμπλοκο ενός τριπεπτιδίου και ενός ιόντος χαλκού.